[聚集行]超详细的热图绘制教程(5000余字)，真正的保姆级教程

微生物重要信息自学的恰当坐姿

NGS系列产品该文包括、、mRNA组预测 （）、ChIP-seq预测 （）、原生动物定序预测 ()、DNA磷酸化预测、重定序预测、GEO统计数据数据分析（）、等内容。

以下该文原初源于蜜蜂生信 ，译者蜜蜂生信

间接来源R词汇统计数据与绘图，抒发式说明来自医学系堂。

时常会想到用科水狼来展现某一DNA或这类DNA的抒发量问题，今天用R中的包一点一点绘出科水狼。

假如不该写标识符，新浪网版可以满足用户大部分需求，

系统自学R见

目 录

1. 绘图前准备1.1 增设组织工作产品目录1.2 加装和加载R包1.3 加载查阅统计数据数据2. 绘出科水狼3. 自订科水狼3.1 科水狼纵向技术标准3.2 绘图外形修正3.3 除去横横坐标条码3.4 修正示意图3.5 增设手写体3.6 修正横纵向控制点3.7 修正各组条码视角3.8 加进绘图副标题3.9 修正热块大小3.10 分割控制点科水狼计算机程序3.11 修正科水狼显示值3.12 记号科水狼计算机程序4. 构筑各组重要信息4.1 构筑纵向各组重要信息4.2 构筑纵向各组重要信息4.3 共同女团两者5. 留存绘图6. pheatmap()抒发式说明

首先去除配置文件，增设组织工作产品目录，组织工作产品目录是R用以加载文档和留存结果的预设产品目录。

我一般是在C盘增建一个文档夹当作R的组织工作产品目录，所有的文档都导入到这里面处理。

加装我们绘图须要用的包，假如已加装，间接加载就好了。

模拟统计数据数据不是内建统计数据数据集，如须要模拟统计数据数据，请前台申明方可完全免费以获取。

先绘出个基本款的科水狼。

基本绘图

增设技术标准方向，对其纵向技术标准。

增设边框为白色，去掉纵向、纵向控制点。

去掉横横坐标中的id。

去掉横轴和纵轴的名称

将右上角的示意图去掉

更改示意图范围

增设图中字的大小，使用fondsize参数来增设。

增设字的大小

分别指定纵向和纵向手写体大小，使用和参数增设。

改变纵向和纵向手写体的大小

分别增设纵向纵向的树高，使用和参数增设。

增设纵向和纵向控制点科水狼的树形高度

增设控制点的距离类型，使用参数指定，分为如下几类：。

控制点的距离类型

修正控制点的方法，使用参数指定，可选有

修正控制点的方法

增设各组条码的视角，可以使用参数指定，可选有270、0、45、90、315等。

各组是否斜体，旋转多少度

给绘图增加副标题，可以使用参数指定。

图片加进主题

分别修正科水狼方块宽度和高度，可以使用和参数指定。

修正科水狼的宽度和高度

根据科水狼控制点对其进行计算机程序儿分割，可以使用和参数指定

对控制点科水狼进化分割

在上图基础上增加边缘线。

给科水狼块儿边缘加进颜色

科水狼上是否展现值，大小和颜色，大小以及值展现类型，可以使用、、、等参数增设。

使用参数指定是否显示值。

加进fpkm至科水狼方块儿内

使用参数指定值的显示大小。

加进值大小（放大缩小）

使用参数指定值的颜色。

增设值的颜色

使用number_format参数指定值显示类型，下图显示为科学计数法。

增设值的类型

对科水狼方块儿进行记号；，假如该值大于1，则为+，否则为-。

为科水狼方块儿内容加进记号

构筑纵向和纵向各组重要信息(有3个处理，分别是：盐、干旱和热应激)；以及时间：0-3day，对3类DNA21个DNA进行各组，分别是："WRKY", "AP2", "YABBY"。

可以留存为pdf/jpeg/png格式，建议留存为pdf/jpeg，因为两者清晰度高。

本文完。

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本文转载自蜜蜂生信，抒发式说明复制自医学系堂。

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