[核酸采样液一般为多少毫升]5混1、10混1、20混1…PCR混样检测的极限在哪里?
译者:exileApp,译者: DNA谷,(http://xueqiu.com/1912517390/209800171)
此首诗译者:原教授带你做检测。
先剖析一下新冠病原体体多肽混样检测的心路历程:
一、5合1混样
2020年7月21日中华人民共和国国务院应付新式流感病原体体肺结核禽流感共管共管监督机制医疗保健抢救组发布了《新冠病原体体多肽筛检溶化混样检测控制技术提示》
一、适用于第一类
新式流感病原体体多肽筛检溶化混样控制技术(下列全称溶化混样)仅适用于于大群体样品的筛检,溶化混样检测结果不作为最后诊断依照。在群体整体误诊率较高(高于0.1%)时更加适于。下列群体不建议采用溶化混样检测:
(一)重点地区群体(上周有禽流感发生的住宅小区含诊断疑似病例和此病病患、阿尔布津住宅小区、人口稀疏住宅小区、农村居民聚集地和上周离省内出群体)、其他不适宜溶化混样检测的群体;
(二)公立医院急诊病人。
二、细菌药理学条件
1.依照《病原体微细菌细菌药理学细菌安全可靠管理工作条例》(中华人民共和国国务院424发布命令),具有在县级的市级上海市人民政府环境卫生身心健康行政部门登记的细菌安全可靠三级及以上细菌药理学。
2.依照《公立医院医学DNA扩充检测细菌药理学管理工作配套措施》(卫办医牛驼〔2010〕194号),具有经过市级环境卫生身心健康政府部门审查登记的医学DNA扩充检测细菌药理学。
3.药理学检测细菌药理学(常称为服务器端细菌药理学)应合乎《药理学检测细菌药理学基本国际标准(全面实施)》《药理学检测细菌药理学管理工作规范化(全面实施)》等要求。
三、操作流程
1.咽拭子取样方法。被采集人员头部微仰,取样者将拭子越过舌根,在被采集者两侧咽扁桃体稍微用力来回擦拭至少3次,将拭子头浸入含1~3ml病原体体保存液(也可使用等渗盐溶液、组织培养液或磷酸盐缓冲液)的管中,尾部弃去,旋紧管盖。
2.样品混合。将采集的数个样品(原则上不超过5个)各取200ul进行充分混合,形成混合待检样品。
该控制技术提示重点强调了适用于条件和细菌药理学条件,混样数量不超过5个。
二、10合1混样
2020年8月17日中华人民共和国国务院应付新式流感病原体体肺结核禽流感共管共管监督机制医疗保健抢救组发布了《新冠病原体体多肽10合1混采检测控制技术规范化》
一、样品采集耗材规格
(一)病原体体采集管
管帽和管体应为聚丙烯材质,螺旋口可密封,松紧适度。管体透明,可视度好。试管外径(14.8±0.2)mm×(100.5±0.4)mm, 管帽外径(15.8±0.15)mm,高度(12.5±0.5)mm。容量企业定标10 ml,内含6ml胍盐或其他有效病原体体灭活剂的保存液。保存液应带有易于观察、辨识的颜色(如粉红色),并保持一定的流动性,方便取样。
(二)采集拭子
宜选用聚酯、尼龙等非棉质、非藻酸钙材质的拭子,且柄部为非木质材料。折断点位于距拭子头顶端3cm左右,易于折断。
10合1混采检测控制技术规范化从样品采集耗材规格、采集地点要求、采集流程、标本送检、细菌药理学接收、标本检测与质量控制、检测结果处理、检测后样品处理、控制技术人员基本要求、细菌安全可靠防护等十个方面详细规定了相关的控制技术细节。
三、20合1混样
2022年1月15日中华人民共和国国务院应付新式流感病原体体肺结核禽流感共管共管监督机制医疗保健抢救组发布了《新冠病原体体多肽20合1混采检测控制技术规范化》
一、样品采集耗材规格
(一)病原体体采集管
管帽和管体应为聚丙烯材质,螺旋口可密封,松紧适度。管体透明,可视度好。采集管高度( 12.5±0.5 ) cm,容量企业定标20-30mL,内含11-12mL 胍盐或其他有效病原体体灭活剂的保存液。保存液应带有易于观察、辨识的颜色(如粉红色),并保持一定的流动性,方便取样。
(二)采集拭子
宜选用聚酯、尼龙等非棉质、非藻酸钙材质的拭子,且柄部为非木质材料。折断点位于距拭子头顶端3cm左右,易于折断。
二、采集地点要求
选择空旷、通风良好的场地作为大规模群体筛检集中采集地点。依照原有场地条件,划分为等候区、采集区、缓冲区和临时隔离区,有效分散待检人员密度。应设置急救设备备用。
(一)等候区
设置人行通道,同时设置一米线保证等候人员的防护安全可靠。依照天气条件配备保温、降温,遮阳、遮雨等设施。老年人、儿童、孕妇和其他行动不便者优先采集。
(二)采集区
依照气候条件,配备帐篷、冷/暖风扇、适量桌椅,保证医务人员在相对舒适环境下工作。配备采集用消毒用品、拭子、病原体体采集管,并应为受检人员准备纸巾、呕吐袋和口罩备用。标本如无法及时运送至细菌药理学,需准备4℃冰箱或低温保存箱暂存。应制定防止病原体微细菌扩散和感染的应急预案。
(三)缓冲区
空间应相对密闭,可供采集人员更换个人防护装备,放置与取样点规模相匹配的防护用品、采集用消毒用品、拭子和采集管,户外消杀设备。
(四)临时隔离区
用于暂时隔离在采集过程中发现的疑似病人或高危群体。
三、采集流程
(一)标识及信息登记
1.登记流程:工作人员在采集前分配20个受检者为一组,采集前收集并登记受检者相关信息(包括姓名、性别、身份证号、联系电话、采集地点、采集日期和时间),按照组别进行采集管编号。因20人相对较多,为避免不同组人员弄混,取样时,可采用2米线将下一组等候人员与正在采集的一组人员严格分隔开来,该组人员采完后,下一组人员才能有序进入取样区。
2.登记要求:推荐使用身份证读卡器、二维码条码等信息化手段关联受检者信息,提高信息读取效率和准确性。
(二)采集方法
被采集人员头部微仰,嘴张大,发啊音,露出两侧咽扁桃体,采集人员将拭子越过被采集人员舌根,在两侧咽扁桃体稍微用力来回擦拭至少3次,然后在咽后壁上下擦拭至少3次。操作完毕后,将拭子头置入管中、拭子折断点置于管口处,稍用力折断使拭子头落入采集管的液体中,弃去折断后的拭子杆,旋紧管盖,将采集管置于稳定的置物架上。每例采集后采集人员均应进行手消毒。
(三)混合拭子
依照上述采集方法依次采集其余19支拭子,将完成采集的拭子放入同一采集管中,动作轻柔,避免气溶胶产生。连续采集20支拭子以后,旋紧管盖,防止溢洒。注意咽拭子需浸入保存液内。如采集管内拭子不足20支,应做好特殊标记并记录。
四、标本送检
(一)核对信息
核对采集管标签与混采登记表信息,确保准确完整,编号一致。
(二)标本放置要求
将核对后的采集管放入透明塑料密封袋(一层容器)中并封严袋口,用75%乙醇喷洒密封袋外部。将密封袋放入二层容器(可选内配适量吸湿材料的包装盒或双层医用垃圾袋),密封后用75%乙醇喷洒消毒。将二层容器放入具有细菌危害标识的专用标本转运箱(推荐使用合乎《危险品航空安全可靠运输控制技术细则》A类物品运输UN2814国际标准的转运箱),二层容器和转运箱之间应放置降温凝胶冰袋。二层容器应固定在转运箱中,保持标本直立。密封转运箱后,使用75%乙醇喷洒消毒,转运箱表面洁净无污染。
(三)标本转运要求
国际标准转运箱应由专门标本运送人员负责运送。标本应在采集后2-4小时内送至细菌药理学。不能立即送检的,应配备专门的冰箱或冷藏箱保存,并做好标本接收、保存登记。标本采集后24小时内可置于4℃保存。
五、细菌药理学接收
(一)标本签收
运送和接收人员应对标本进行双签收。接收人员检查转运箱、二层容器有无破损。
(二)标本打开
应在细菌安全可靠三级细菌药理学核心区打开转运箱,取出二层容器。在细菌安全可靠柜中打开二层容器,用75%乙醇喷洒或擦拭消毒后,取出密封袋,用75%乙醇试剂喷洒或擦拭消毒,并检查是否密封完好。
(三)标本检查
取出采集管,检查管壁是否有破损、管口渗漏等,确认无破损、渗漏后用75%乙醇喷洒或擦拭消毒。如有破损、渗漏,应立即停止操作,用吸水纸覆盖后使用0.55%含氯消毒剂进行消毒处理,做好不合格登记后销毁。
(四)标本保存
不能及时检测的标本放入专用冰箱保存。24小时内检测的标本可置于4℃保存。24 小时内无法检测的标本应置于-70℃或下列温度保存。如无-70℃保存条件,则于-20℃暂存。避免标本反复冻融。设立专库或专柜保存标本,双人双锁管理工作。
(五)转运容器移出
使用后的二层容器内外壁经75%乙醇擦拭消毒后移出细菌安全可靠柜,实验结束后使用紫外灯照射消毒。
七、检测结果处理
新冠病原体体多肽定性检测报告应包括检测结果(检出/阳性、未检出/阴性)、方法学、检出限等。
(一)结果判断
依照所用扩充试剂说明书,判断检测结果为未检出/阴性或者检出/阳性。
(二)阳性结果复核
1、混采检测结果为阳性、灰区或单个靶标阳性,通知相关部门对该混采管的20个受试者暂时单独隔离,并重新采集单管拭子进行复核。
2、复核单管多肽检测如均为阴性,则按照阴性结果回报。暂时隔离人员即解除隔离;如检测结果阳性,按程序上报。
四、混样检测的无限大在这儿?
混样检测的前提是预期误诊率。当误诊率在1%时,最佳混样数量是11混1,当误诊率是5%时最佳混样数量是5混1。
混样效能计算公式:
首先混样的结果中只有阴性或阳性,每次试验都是相互独立的随机事件。
误诊率为,混样数量为,则有:
1.检测为阴性的组,每个样品平均的检测次数为,概率为;
2.检测为阳性的组,每个样品平均的检测次数为,概率为;
预期每个样品的检测次数E(x)为:
总的预期检测数量,也称为混样检测效率F:
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? F=1/E(x)
预期每个样品的检测次数E(x)越低,代表着混样检测越划算,1-E(X)则表示检测量减少的比例。
当误诊率为0.1%时,依照计算,理论上100混1仍然是可行的,但是这个公式的前提是不论多少混1,只要混样中有1个阳性都能检出。在现实当中,混样检测之前除了需要先预估误诊率,并且要考虑检测系统的灵敏度,以及对混样可能造成的漏检(假阴性)风险进行评估。
《新冠病原体体多肽20合1混采检测控制技术规范化》的出台,对新冠病原体体多肽检测的灵敏度又提高了要求,500拷贝/毫克的最低检测限的国际标准可能也需要更新了,很多大体积提取试剂和高灵敏度的扩充试剂厂家已经摩拳擦掌了。但是对于混样应有的态度是:混样检测需慎之又慎!
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